يكون الطالب مؤهلا للعمل في الوزارات و المؤسسات المختلفة ولا سيما وزارة التربية والتعليم ووزارتي الزراعة والصحة وسلطات البيئة والمياه . وكذلك بالإضافة لما سبق يكون خريج التكنولوجيا الحيوية ذا مقدرة على القيام بالأعمال الحرة في المجالات الصناعية والزراعية.
كذلك بدأ القسم بتوظيف الطلبة بدءا من الفصل الدراسي الأول 2006/2007 حيث يختار القسم الأول على الطلاب والأولى على الطالبات للعمل بالساعة لمدة عام كمعيد/ة.