يستمد قسم الكيمياء رسالته من الرسالة العامة التي تتبناها الجامعة الاسلامية بفلسفتها الاسلامية من حيث العمل علي النهوض بالمجتمع الفلسطيني من الناحية العلمية من خلال:

1. تخريج جيل من الخريجيين المؤهليين و القادرين علي دفع عجلة التطوير و الابداع في المجتمع الفلسطيني و ذلك من خلال توفير البيئه العلميه المناسبه للطلبه و طرح مساقات علميه متطوره و توفير مختبرات علميه حديثه

2. تطوير الواقع العلمي المرتبط بشكل مباشر أو غير مباشر بعلوم الكيمياء بغية خدمة المجتمع

3. تطوير البحث العلمي في مجال الكيمياء لمواكبة التقدم العلمي العالمي و تعزيز التعاون الأكاديمي مع

    الجامعات المحلية و الدولية

4. التواصل مع مؤسسات المجتمع بهدف تطويرها و تزويدها بالخبرات العلمية من اجل تطوير أدائها بما يخدم المجتمع الفلسطيني.