يهدف برنامج بكالوريوس البيئة وعلوم الأرض إلى تطوير وتأهيل كوادر فلسطينية من خلال تقديم تعليم عالي متميز للطلبةالملتحقين بالبرنامج حيث يكسبهم المعارف العلمية اللازمة ومهارات التفكير العلمي المنظم . ولقد تم وضع فلسفة وأهداف البرنامج انطلاقا من فلسفة وأهداف الجامعة الرئيسية ومن خلال فلسفة وأهداف كلية العلوم، و يمكن صياغة أهداف البرنامجكما يلي :
 
1.  تغطية حاجة المجتمع الفلسطيني بالمختصين في مجال علوم الأرض و البيئة .
2.  المساهمة في حل المشاكل البيئة التي يعاني منها قطاع غزة .
3. إجراء الأبحاث و الدراسات البيئية التي تعنى بالمشاكل البيئية المختلفة .
4. التعرف على المصادر الطبيعية في فلسطين من خلال الأبحاث الجيولوجية وطرق استغلالها .
5.  ترشيد استخدام المصادر الطبيعية في فلسطين مع الأخذ في الاعتبار الأبعاد و المخاطر البيئية .
6.  عقد دورات تدريبية في مجالات التحاليل البيئية و التقييم البيئي .
7.  زيادة الوعي البيئي بين أبناء شعبنا عن طريق عقد ندوات و محاضرات عامة .
8.المشاركة في مشاريع إقليمية ودولية من شأنها أن تساهم بالمحافظة على البيئة على المستوى الإقليمي والعالمي .